育种5.0:人工智能解码种质资源加速作物创新

作者:国科农研院 内容团队 2025/9/17 9:49:00
作物育种技术对全球粮食安全至关重要。虽然传统方法已提高了产量、抗逆性和营养品质,但气候变化、土地流失和病虫害压力等新挑战需要创新解决方案。本文提出由人工智能(Artificial Intelligence,AI)和机器人技术驱动的"育种5.0"框架,标志着从经验选择向智能系统的转变。这一变革的核心在于AI新发展的"理解种质"能力——不仅能识别遗传标记,还能解码其结构、可塑性、调控逻辑与环境互作。这
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作物育种技术对全球粮食安全至关重要。虽然传统方法已提高了产量、抗逆性和营养品质,但气候变化、土地流失和病虫害压力等新挑战需要创新解决方案。本文提出由人工智能(Artificial IntelligenceAI)和机器人技术驱动的"育种5.0"框架,标志着从经验选择向智能系统的转变。这一变革的核心在于AI新发展的"理解种质"能力——不仅能识别遗传标记,还能解码其结构、可塑性、调控逻辑与环境互作。这种种质智能实现了性状预测建模、亲本优化设计和靶向选择。我们定义了促成这一转变的四大技术范式:(i)多模态数据整合连接基因型与表型;(ii)全模拟环境进行虚拟性能测试;(iii)无人化数据采集实现规模化精准;(iv)专家化可解释AI支撑生物学决策。这些技术将种质资源算法化为可操作的育种见解,加速从理想株型设计到优良品系开发的全周期。我们进一步提出"育种飞轮"——一个通过持续放大表型增益和优化育种策略实现自我强化的系统,为可持续粮食未来提供更快速、更智能的作物改良方案。


育种技术代际发展

育种1.0:基于经验的传统选择,依赖表型观察但效率低下。

育种2.0:孟德尔遗传学指导的杂交育种,建立量化选择理论。

育种3.0:分子标记辅助的基因组选择,实现分子水平精准操作;

育种4.0:生物技术与大数据的融合,CRISPR等工具使基因编辑更精确;

育种5.0AI驱动的智能育种,通过多组学数据整合和算法优化实现自主决策。

从育种1.05.0的演进展示了作物改良的技术演变,从传统经验主义转向科学方法,从分子生物学转向大数据分析,从精准育种转向全面智能系统。每一代突破都系统提升了育种效率和选择准确性,为农业现代化可持续发展奠定了基础能力。展望未来,下一代AI、功能基因组学和异构大数据的融合将推动育种技术向超智能操作和原子级精度发展。这些进步将为应对粮食安全需求、气候适应要求和资源优化约束等全球性挑战提供有力技术解决方案。

全球作物育种技术目前处于并行发展阶段,发达国家以育种4.0为主导(如AlphaFold、生成模型和生物大模型正在推进育种5.0),而非洲和发展中地区仍依赖育种2.0-3.04.0应用尚处起步阶段。多代育种技术在地区内外的共存,共同支撑着育种5.0(生成式育种)的出现。AI的融合通过推动从经验方法向数据驱动智能决策的转变,重振了传统框架,在不断发展实践中展现出AI与农业创新日益深化的融合。

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AI技术代际发展

人工智能作为计算机科学的重要分支,通过模拟人类智能使机器能够执行语言处理、图像识别和决策制定等任务。AI的演进可分为五个不同发展阶段:

第一代:规则推理系统(1956-1980)。如专家系统和演绎推理,受限于缺乏自学习能力。

第二代:统计机器学习(1980-2000)。实现基本模式识别(如让机器识别猫时,最简单的方法是提供大量猫图像,机器通过数据分析总结出耳朵、胡须和毛发等共同特征,从而识别新照片中的猫)。

第三代:深度学习神经网络(2010-2018)。使用多层架构进行非线性分层处理,能自主从数据中提取高级特征完成复杂任务。

第四代:强化学习与自监督学习(2018-2022)。通过与环境的自主交互,机器能在无明确指令下优化决策过程,在动态场景中展现适应性。

第五代:生成式AI与通用人工智能(AGI)(2022-)。具备跨领域认知、因果推理和多模态感知等类人能力。第五代AI整合了四大战略能力:生成合成(从现有数据创造新内容)、预测分析、自主决策和复杂逻辑推理。生成式AI侧重基于现有数据创造新内容,强调创造性和生产;而基础模型作为技术支柱,利用海量数据和训练提供强大通用能力,构成第五代AI的核心支持,代表着技术发展的重要方向。

这一演进路径展示了从单一任务处理到复杂认知系统的技术跃迁,为农业智能化奠定了算法基础。特别值得注意的是,基础模型(如ChatGPT)的出现推动了AI在农业决策支持、DNA序列分析和种质挖掘等全链条育种环节的应用,使AI成为现代作物改良的核心支柱。


AI在作物育种中的应用

AI在育种中的应用随技术代际呈现差异化特征:

第二代AI(育种3.0):贝叶斯网络和隐马尔可夫模型(HMMs)用于表型降维和性状预测;

第三代AI(育种3.0):支持向量机(SVM)和随机森林(RF)实现高维数据分类;

第四代AI(育种4.0:卷积神经网络(CNN)处理空间特征,循环神经网络(RNN)建模时序数据;

第五代AI(育种5.0):多模态基础模型(如GPT)整合自然语言与生物数据,支持全链条决策。

特别值得关注的是,第五代AI在种质资源深度挖掘中展现出变革潜力:通过整合基因组、表型组和环境组数据,AI能解析复杂性状的遗传架构,预测优良等位基因组合,优化杂交设计,大幅缩短育种周期(从5-8年压缩至2-3年)。这种"AI解码种质"的能力正将静态基因库转化为动态智能数据源。

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机器人技术应用

受人类智能生物学基础启发,算法系统承担类脑高级认知功能(对应人类大脑皮层的高级认知能力),而机器人系统则作为神经信号类比物支配的效应器官(类比人类运动系统)。此处的"机器人"不仅指具身人形机器人,还包括各类智能自动化驱动产品如无人机、自动驾驶系统、无人地面车辆、四足机器人和具身智能。在育种领域,机器人系统可应用于多个场景:表型性状采集、栽培管理与自动化生产、收获作业、快速育种和基因编辑辅助。

微观操作:胚胎显微注射平台实现高精度遗传转化、单细胞分离系统支持高通量操作、AI驱动的蛋白质工程平台加速功能设计。

表型采集:地面机器人进行近距表型扫描、无人机搭载多光谱传感器实现大田监测、3D重建技术提升原位分析精度。

田间管理:自主导航设备完成精准播种/施肥、智能温室系统实现环境闭环调控、机器视觉引导的收获机器人提升效率创新理论框架。

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育种5.0的核心框架

AI-机器人协同驱动的育种飞轮

育种5.0的突破性在于构建"育种飞轮"flywheel)——一个数据驱动的自我强化系统。飞轮隐喻描绘了从启动到持续增长的过程。最初需要大量推动力,系统逐渐积累动能,进入自我维持的加速阶段,最终建立自我强化的增长循环。

启动阶段部署传感器网络和机器人终端,积累初始数据集这一阶段是启动飞轮的关键能量积累期。一旦运行,高速育种机器人精准执行AI生成的指令,在温室或田间条件下完成播种、表型扫描和样本收集等任务。

加速阶段AI分析多维数据(基因组、表型、环境),优化育种方案。多维数据流持续输入AI育种大脑,驱动深度学习迭代改进以分析抗病性状、预测环境影响产量和模拟基因组合。准确性提升使AI能优化杂交策略,将育种周期从5-8年压缩至2-3年,同时识别抗旱、抗虫或营养强化候选品种。

自循环阶段优良品种推广产生新数据,持续迭代模型。田间部署的优良品种产生新的物联网采集数据,形成闭环系统:快速品种释放→扩大数据规模→更智能模型→加速育种迭代。这一框架允许快速气候适应和靶向育种(如高蛋白小麦、耐盐水稻),为粮食安全提供可持续解决方案。

AI驱动的HOPE技术体系

随着AI技术进步,育种5.0的愿景是通过AI无缝整合多个关键流程,创建智能育种管理系统。

High-Dimension:千维表型特征解析

Omni-Simulation10^6种环境场景测试

Peopleless99%自动化操作覆盖率

Explainable:生物学可解释决策路径

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这一框架依托四大支柱技术

高维多模态数据整合分子到生态系统级信息。在时间维度上,AI通过持续聚合历史数据和追踪作物发育的详细变化提升预测准确性。空间上,AI扩展数据采集至不仅包含地面传感器,还整合遥感技术(如卫星影像),延伸至从无土栽培到田间管理的各类环境。这种全息数据整合使育种者能全面理解基因型-环境互作,为精准育种决策提供科学依据。

全模拟环境数字孪生预测品种表现。全模拟育种代表了一种革命性方法,通过创建虚拟环境预测作物在各种条件下的表现。AI驱动的模拟平台能构建数字孪生作物,在投入实际田间试验前测试数千种基因组合和环境场景。这种"在硅片中育种"方法大幅减少对物理试验的依赖,加速育种周期并降低成本。

无人化系统机器人实现规模化精准操作。无人化管理代表育种操作的根本性变革,通过机器人系统和物联网技术实现全流程自动化。从自动化温室到智能田间机器人,这些系统能全天候不间断执行播种、灌溉、施肥和表型采集等任务。AI算法实时分析传感器数据并动态调整管理策略,形成闭环优化系统。无人化管理的优势不仅在于提升效率和降低成本,还在于最小化人为因素对作物生长的干扰。

专家化可解释AI确保决策透明可靠。虽然AI在育种应用中展现出卓越的数据处理能力和决策优势,但其透明度和可解释性同样关键。特别是在影响人类伦理和福祉的领域,AI决策过程必须可理解和可追溯,确保技术进步与社会价值和伦理原则一致。可解释AI技术将发挥关键作用,使专家和育种者能阐明AI驱动决策的依据,从而增强对AI系统的信任。


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育种5.0:硅基系统服务碳基可持续发展

在第五代AI的强劲驱动下,育种5.0和飞轮育种技术正以空前速度革新作物育种效率。通过精确数据分析和预测建模,科学家能快速识别具有高产、抗逆和低农药依赖等优良性状的品种,显著提升农业生产力和可持续性。

同时,无人化管理和垂直农业的兴起为现代农业带来革命性变革。利用先进传感器技术和自动化控制系统,农业生产现可实现精准化、智能化管理,确保产品质量与安全。这些创新还大幅减少水和肥料投入,节约率超过90%。这些进步对缓解全球水资源短缺、减少环境污染和推进可持续农业实践具有深远意义。

更令人振奋的是,这些技术进步为未来人类火星移民提供了潜在农业解决方案。在极端环境条件下,技术与生物系统的深度融合可能实现在火星建立自给自足的农业生态系统。这些系统将为星际探索和殖民提供必要物质基础,展示地球衍生的精准农业和闭环资源管理创新如何适应地外生命维持。

展望未来,我们有充分理由相信,随着技术进步和持续创新,人类将更深入理解和更好利用自然规律,实现与环境的和谐共生。我们将为后代留下更繁荣、健康和可持续的世界,让他们在技术指引下继续探索宇宙奥秘,书写人类历史新篇章。让我们携手共创充满希望与可能的未来。


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来源:水稻分子育种

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